Especialidades

Ing. de Computadores

Tutor

CAMINERO HERRÁEZ, Mª BLANCA
MORENO GALDON, RAUL

Descripción y Objetivos

Las aplicaciones para genómica suelen caracterizarse por basarse en el procesamiento de una gran cantidad de datos. 

A su vez, el paradigma de programación MapReduce ha surgido con fuerza en los últimos años para facilitar el procesamiento masivo de datos, aprovechando de manera eficiente numerosos recursos computacionales como clústers e incluso recursos virtuales basados en tecnología Cloud, en el marco que se conoce actualmente como la era del "Big Data".

El presente TFG tiene como objetivo general el estudio y migración de una aplicación particular de genómica al mencionado paradigma MapReduce. Con ello se podrían aprovechar las características inherentes de la elevada escalabilidad y tolerancia a fallos que este paradigma ofrece, permitiendo aumentar el rendimiento y robustez de la aplicación.

Metodología y Competencias

El objetivo general planteado para este TFG se abordará a través de los siguientes pasos:

1. Estudio del paradigma de computación Map/Reduce, y de su implementación Hadoop

2. Análisis de la aplicación de genómica

3. Identificación de las partes de la aplicación susceptibles de migración

4. Preparación, diseño e implementación de los datos de entrada y de las funciones Map y Reduce

5. Validación de la aplicación desarrollada

6. Evaluación de prestaciones

Medios a utilizar

• PCs y Clústers de cálculo, disponibles en el I3A.

• Aplicación de genómica desarrollada en el I3A.

• Software de libre disposición (Hadoop, compiladores, S.O. Linux, OpenNebula....).

Bibliografía

• Sobre Hadoop: http://hadoop.apache.org/

• Sobre la aplicación de genómica: http://www.opencb.org/

Asignación

El Trabajo Fin de Grado ha sido a asignado a Don/Doña Mª Llanos Cifuentes Cabañero