cambiar a curso:   2014-15   2016-17


Trabajo Fin de Grado 2015-16
 Calibración de un sistema para el reconocimiento y conteo de células a partir de imágenes microscópicas


Especialidades
Computación


Tutor
OSSA JIMENEZ, LUIS DE LA
BERMEJO LOPEZ, PABLO


Descripción y Objetivos

El proyecto consiste en la elaboración de algoritmos para la calibración de un sistema  que, mediante técnicas de aprendizaje automático, permite reconocer, clasificar y contar, distintos tipos de células a partir de imágenes microscópicas. 

Dicha calibración consiste fundamentalmente en la estimación de los parámetros y umbrales óptimos que han de ser utilizados en el preprocesamiento de las imágenes, y será llevada a cabo mediante algoritmos evolutivos.



Metodología y Competencias

El proyecto parte de un conjunto de imágenes microscópicas en las que cada célula está marcada previamente, y de un algoritmo que trata de aislar la imagen individual de cada célula, de cara a la creación de una base de datos que será la utilizada para entrenar el clasificador.

- En una primera fase, el proyecto consistirá en mejorar el algoritmo de extracción de imágenes disponible. Esta mejora incluirá la introducción de algunos parámetros relativos a la imagen y al modo en que se lleva a cabo el algoritmo.

- En una segunda fase, se diseñará e implementará una función de evaluación de modo que, dados unos parámetros, permita cuantificar el rendimiento del algoritmo.

- En la última fase, se utilizará un algoritmo evolutivo para determinar los parámetros óptimos para el algoritmo.



Medios a utilizar

Programación en C y C++ o Matlab

Haber cursado las asignaturas de Minería de Datos y Diseño de Algoritmos.



Bibliografía
  • Fundamentals of Digital Image Processing: A Practical Approach with Examples in Matlab. Chris Solomon, Toby Breckon.
  • Essential Matlab for Engineers and Scientists. Brian H. Hahn. Daniel T. Valentine.
  • Documentación de weka: http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/documentation.html
  • Apuntes de la asignatura Minería de Datos.
  • Apuntes de la asignatura Diseño de Algoritmos.


Asignación
Pendiente de asignar