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Trabajo Fin de Grado 2015-16
 Diseño de un sistema para la localización y conteo de células en imágenes microscópicas.


Especialidades
Computación


Tutor
OSSA JIMENEZ, LUIS DE LA
MARTINEZ GOMEZ, JESUS


Descripción y Objetivos

El objetivo de este trabajo es el diseño, implementación y comparación de algoritmos eficientes para la detección de células en imágenes microscópicas.  Dichos algoritmos se basarán en diversos paradigmas, como la detección de bordes o el clustering basado en densidad. 

Para el entrenamiento del modelo, se contará con un conjunto de imágenes en los que las células han sido ya localizadas.

Este trabajo se enmarca en la fase preliminar de desarrollo de un sistema automático de reconocimiento y conteo de células en el ámbito de la investigación en lesiones medulares.



Metodología y Competencias

Este trabajo consta de varias fases.

  • Estudio del problema y recopilación de técnicas existentes en el campo del conteo de células. Selección de técnicas más adecuadas.
  • Implementación y evaluación de algunas de las técnicas.
  • Análisis de los resultados e implementación de mejoras.
  • Evaluación final de las técnicas.


Medios a utilizar

Es necesario el dominio de C++ y/o matlab, ya que proporcionan librerías que permiten manejar con facilidad las imágenes. También se utilizará el programa ImajeJ para el preproceso.

También es recomendable (aunque no impresdindible) haber cursado Diseño de Algoritmos y Minería de Datos.



Bibliografía
  • Fundamentals of Digital Image Processing: A Practical Approach with Examples in Matlab. Chris Solomon, Toby Breckon.
  • Essential Matlab for Engineers and Scientists. Brian H. Hahn. Daniel T. Valentine.
  • Documentación de weka: http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/documentation.html
  • Apuntes de la asignatura Minería de Datos.
  • Apuntes de la asignatura Diseño de Algoritmos.
  • Documetnación de ImageJ


Asignación
Pendiente de asignar