Tecnologías Específicas

Ingeniería del Software
Tecnologías de la Información

Descripcion y Objetivos

El índice de combinación (CI en sus siglas en inglés) de fármacos se utiliza para estudiar la influencia que tiene la agregación de dos fármacos. Así, por ejemplo, cuando el efecto es sinergético, el fármaco resultante de la combionación mejora las terapias.

Para el cálculo del mismo se han de disponer de datos experimentales realizados en laboratorio con ambos fármacos, y probablemente, con la combinación de ambos de cara a validar el CI.

En el artículo "Drug Combination studies and Their Synergy Quantification Using the Chou.Tallay Mehod" de Ting-Chao Chou publicado en la revista Cancer Research en Enero de 2010, se introduce un método que permite realizar el cálculo de dicho CI.

A raiz de esta publicación, y muchas otras, surgieron herramientas para calcular dicho CI tales como Combenefit, del Cancer Research UK - Cambrige Institute, o CompuSyn, de la empresa ComboSyn Inc.

Por tanto, el objetivo principal de este Trabajo Fin de Grado es desarrollar una herramienta similar a la anterior pero con diferencias significativas:

.- Basada en software libre y de código abierto para que suponga una herramienta de la comunidad para la comunidad.

.- Interfaz más sencilla y en general más intuitiva en cuanto al manejo que las existentes.

.- Permitir diferentes formatos de entrada de datos, por ejemplo texto u hoja de cálculo, tanto con un corta y pega así como la importación directa.

.- Basada en tecnologías web de manera que permita su ejecución tanto en modo local en el ordenador de cada investigador, como en un servidor para servir a la comunidad.

.- Al realizarse un diseño basado en web, se ha de garantizar un mínimo de seguridad de la aplicación tanto en la manera de acceder por cada usuario de la misma (usuario y contraseña), como de seguridad externa al estar conectado el equipo a internet.

.- Debe cumplir con todos los requisitos de los estándares de desarrollo de software en entorno médico. Esto se ha de contemplar en la fase de diseño.

 

Metodología y Competencias

Las especialidades que se requieren para poder acceder a este proyecto garantizan que el alumno ya conoce metodologías de análisis y diseño, así como las herramientas a emplear en el desarrollo del mismo.

La metodología a emplear será una metodología ágil con continuas entrevistas, a priori mediante videoconferencia, con la Dra. María del Carmen Ramírez Castillejo, tutora de este TFG y experta en investigación contra el cáncer.

Los pasos a seguir en el desarrollo de este proyecto son:

.- Comprender el término Combination Index y cómo éste se calcula.

.- Estudiar de manera minuciosa las herramientas existentes

.- Análizar y Diseñar la herramienta objeto de este TFG

.- Implementar, conforme a la fase anteior, la herramienta resultado de este TFG

.- Validar los resultados con los obtenidos con las herramientas existentes

.- Validar la conformidad del "cliente final" mediante un estudio de usabilidad de la herramienta, uno de los propósitos fundamentales del desarrollo de este proyecto.

 

En cuanto a las competencias de la especialidad de Ingeniería del Software destacan las siguientes:

IS1] Capacidad para desarrollar, mantener y evaluar servicios y sistemas software que satisfagan todos los requisitos del usuario y se comporten de forma fiable y eficiente, sean asequibles de desarrollar y mantener y cumplan normas de calidad, aplicando las teorías, principios, métodos y prácticas de la Ingeniería del Software

[IS6] Capacidad para diseñar soluciones apropiadas en uno o más dominios de aplicación utilizando métodos de la ingeniería del software que integren aspectos éticos, sociales, legales y económicos.

Con respecto a las competencia de la especialida de Tecnologías de la Información:

[TI6] Capacidad de concebir sistemas, aplicaciones y servicios basados en tecnologías de red, incluyendo Internet, web, comercio electrónico, multimedia, servicios interactivos y computación móvil.
[TI7] Capacidad para comprender, aplicar y gestionar la garantía y seguridad de los sistemas informáticos.

 

Medios a utilizar

Los medios Hardwaer a utilizar es un ordenador personal.

En cuanto al software, al ser un proyecto basado en software libre, libre es también el acceso al mismo estando disponible en internet.

En cuanto a la bibliografía, en este campo de la ciencia suele estar en abierto. No obstante, los tutores disponen de toda la bibliorgafía necesaria para la consecución de este trabajo.

 

Bibliografía

Cancer Res. 2010 Jan 15;70(2):440-6. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-1947. Epub 2010 Jan 12.

Drug combination studies and their synergy quantification using the Chou-Talalay method.

Chou TC¹.

Molecular Pharmacology and Chemistry Program, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, New York 10021, USA. chout@mskcc.org

 

Compusyn official web page. http://www.combosyn.com/

Combobenefit official web page. https://www.cruk.cam.ac.uk/research-groups/jodrell-group/combenefit